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以氧化亚铁硫杆菌为实验菌株，研究了黄铁矿的Fe^3＋氧化和生物氧化过程中溶液铁离子浓度、pH值以及肌值的变化。结果表明，Fe^3＋由于自身很快会被消耗，因而对黄铁矿的氧化速率较低；而在细菌的作用下，Fe^2＋可以不断被氧化成Fe^3＋，从而使黄铁矿的氧化速率明显加快，因此生物氧化具有更高的效率。基于间接作用机制，结合黄铁矿生物氧化过程中pH值及肌值的变化规律，提出了黄铁矿生物氧化的阶段性特点，即将氧化亚铁硫杆菌对黄铁矿的氧化过程分为黄铁矿无机氧化、Fe^2＋生物氧化和黄铁矿稳定生物氧化3个阶段。