【摘 要】
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目的 分析强化四周抗结核药物治疗对结核病患者肠道微生态的影响。方法 收集青岛市某医院10名强化四周抗结核治疗结核病患者及10名健康对照组的粪便标本,提取细菌基因组DNA,P
【机 构】
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青岛大学公共卫生学院; 山东省临沂市人民医院; 青岛市中心医院肺病研究所;
【基金项目】
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国家自然科学基金面上项目(81673160)
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目的 分析强化四周抗结核药物治疗对结核病患者肠道微生态的影响。方法 收集青岛市某医院10名强化四周抗结核治疗结核病患者及10名健康对照组的粪便标本,提取细菌基因组DNA,PCR扩增16srDNA的V3~V4区特定序列,用Illumina Hi Seq平台测序。对序列进行操作分类单元(operational Taxonomic Unit,OTU)聚类和物种注释;通过Alpha多样性反映单个样品物种丰度及物种多样性;通过主坐标分析(principal co-ordinates analysis,PCoA)观察两组之间菌群结构的差异程度;通过比较门和属水平各细菌的相对丰度来描述菌群结构的差异并进一步采用线性判别分析效应量(linediscriminant analysiseffect size,LEf Se)找出两组的差异菌。采用Mann-Whitney U检验对两组微生物多样性指数进行比较。结果 四周抗结核治疗的Alpha多样性指标Chao1指数和Ace指数分别为(140.13±34.73)和(145.18±30.74),显著低于对照组的(196.56±37.12)和(197.62±31.76)(分别U=13.000,P=0.004; U=11.000,P=0.002);抗结核治疗组的Shannon指数为(2.31±0.57),与对照组(2.89±0.46)相比略有降低,但差异未见统计学意义(U=30.000,P=0.143)。基于binary jaccard的PCoA分析显示两组整体菌群结构有显著差异。抗结核治疗组与对照组比肠道菌群组成发生改变,其中厚壁菌门、毛螺菌科的相对丰度明显低于对照组(46.4%vs.72.4%,χ~2=5.491,P=0.019; 72.4%vs.43.1%,χ~2=5.851,P=0.016);而拟杆菌门、拟杆菌属的丰度明显高于对照组(39.0%vs.18.8%,χ~2=4.166,P=0.041; 31.4%vs.10.3%,χ~2=7.406,P=0.007)。结论 强化四周抗结核药物治疗可使肠道菌群多样性下降,肠道菌群结构失衡;肠道毛螺旋菌科等丰度减少,拟杆菌属等丰度增加。
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