【摘 要】
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用自由能微扰方法(FEP)计算了2种hydroxamate类的抑制剂和MMP-2的相对结合自由能,自由能计算采用了慢增长(Slow Growth)和固定窗口增长(Fixed Width Window Growth)2种方法,
【机 构】
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北京大学化学与分子工程学院,北京大学化学与分子工程学院,北京大学化学与分子工程学院 北京 100871,北京 100871,北京 100871
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用自由能微扰方法(FEP)计算了2种hydroxamate类的抑制剂和MMP-2的相对结合自由能,自由能计算采用了慢增长(Slow Growth)和固定窗口增长(Fixed Width Window Growth)2种方法,并且在每次计算中都采用了双向采样(double-wide sampling)的策略,2种方法计算得到的相对结合自由能都能和实验值很好地符合。
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