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大学治理体系是一个包括大学治理理念、现代大学制度和治理实施机构的有机系统.实现大学治理体系现代化,必须以大学治理的特殊性为基础.大学治理是基于大学组织特殊性的学术组织治理,是源于大学功能和使命特殊性的教育组织治理.推进我国大学治理体系现代化进程,需要把握两个最具现实性的关键问题:一是必须克服大学行政化倾向,把大学作为学术组织和教育机构来治理;二是必须确立大学作为自主办学法人实体的治理主体地位,把大学作为面向社会依法自主办学的法人实体来治理.