【摘 要】
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高通量测序技术的飞速发展,给生物信息学带来了新的机遇和挑战,第二代测序序列数量多、长度短使得原来的序列分析手段不再适用。近几年来,针对高通量测序的序列分析算法和软
【机 构】
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内蒙古农业大学计算机与信息工程学院,内蒙古农业大学动物科学学院
【基金项目】
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国家核高基项目(2010ZX01036-001-001);教育部“春晖计划”项目(Z2009-1-01062);内蒙古自然科学基金资助项目(2010BS0902);内蒙古自治区科技计划项目“云计算系统安全可靠性的测评技术研究及测试平台构建”
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高通量测序技术的飞速发展,给生物信息学带来了新的机遇和挑战,第二代测序序列数量多、长度短使得原来的序列分析手段不再适用。近几年来,针对高通量测序的序列分析算法和软件日益增多,目前已有上百种,导致选择合适的软件成为一个难题。对第二代测序的测序类型、序列类型以及分析算法进行了总结和归纳,对现今常用的分析软件的序列的类型、长度以及软件应用算法、输入/输出格式、特点和功能等方面做了详细分析和比较并给出建议。分析了现今测序技术和序列分析存在的问题,预测了今后的发展方向。
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