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为探索对基础研究项目进行绩效评价的方法,本文结合1998年底对3所医科大学1991年～1995年间获得国家自然科学基金资助的医药类面上项目的投入产出情况调查,从项目参加者情况、经费使用、论文产出、获奖、专利和产业化、获得后续资助及人才培养等方面比较了3所高校的项目投入产出情况;作者对基础研究项目绩效评价的方法进行了讨论,指出绩效评价需要联合多种指标进行综合考查,基础研究项目要重点突出创新性和人才及其研究能力的培养方面的评价.