【摘 要】
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目的 搭建价格便宜的计算机集群用于大规模药物虚拟筛选β位淀粉样前体蛋白分泌酶1(BACE-1)抑制剂.方法 对32台普通个人计算机(PC)进行安装部署Rocks4.3集群操作系统,使用系统自带的默认资源管理软件Sun Grid Engine(SGE),利用AutoDock 4.0在PC集群上进行大规模的虚拟筛选BACE-1抑制剂.结果 针对老年性痴呆发病的关键酶BACE-1成功地虚拟筛选了Sigm
【机 构】
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510080,广州,中山大学中山医学院人体解剖学教研室,510080,广州,中山大学中山医学院人体解剖学教研室,510080,广州,中山大学中山医学院人体解剖学教研室
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目的 搭建价格便宜的计算机集群用于大规模药物虚拟筛选β位淀粉样前体蛋白分泌酶1(BACE-1)抑制剂.方法 对32台普通个人计算机(PC)进行安装部署Rocks4.3集群操作系统,使用系统自带的默认资源管理软件Sun Grid Engine(SGE),利用AutoDock 4.0在PC集群上进行大规模的虚拟筛选BACE-1抑制剂.结果 针对老年性痴呆发病的关键酶BACE-1成功地虚拟筛选了Sigma公司100000个小分子化合物数据库,发现了2个具有开发潜力的苗头化合物.其解离常数分别为303.36和1.79 nmol/L,半数抑制浓度为(91.0±3.5)和(73.0±4.8)μmol/L.结论 利用普通计算机集群系统可以象高性能计算机一样完成药物虚拟筛选工作。
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目的 探索物理损伤与基质细胞衍生因子1α（stromal cell—derived factor-1α，SDF-1α）对大鼠心肌细胞增殖和细胞因子表达的影响。方法培养大鼠心肌细胞，采用刮伤法建立物理损伤模型，添加80μ/L SDF-1α进行联合培养；BrdU法检测各组心肌细胞的增殖能力；碘化丙啶（PI）染色联合流式细胞仪检测各组心肌细胞周期变化；免疫细胞化学法和Western印迹方法检测心肌细胞白
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