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基于在血管壁增强显示方面的强大潜力，近年来多对比度核磁共振成像已成为斑块分析研究的有力工具，但其效能受到多序列图像血管不匹配的影响。为实现多序列图像的准确血管配准，在管腔分割的基础上提出一种由粗到精的两步配准策略：先采用迭代最近点实现多对比度图像中心线的刚性配准，再采用薄板样条实现基于血管边界点的非刚性配准。在第二步配准中，为准确寻找不同序列血管边界的匹配点，创新使用形状上下文描述子对边界点进行筛选，并应用确定性退火技术进行全局优化。采用新型三维多对比度磁共振血管成像序列，对提出算法的有效性进行定量评价。