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目的:研究甘肃不同产地中麻黄间的遗传关系。方法:应用ISSR分子标记技术对甘肃10个不同产地的中麻黄样品进行遗传多样性和亲缘关系分析。结果:从70个ISSR引物中筛选出12个条带清晰、多态性高的引物,共检测出112位点,其中多态性位点81个,多态性条带比率(PPB)为72.32%。聚类结果显示来自不同地区的野生种和栽培种被分开各自聚成一类,地理距离较近的野生种聚为一类。结论:甘肃不同产地中麻黄在物种水平上具有丰富的遗传多样性,中麻黄的遗传距离与地理距离具有一定的相关性。