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电子商务产业是21世纪新型高端朝阳产业之一。高职院校电子商务专业应当依托现代电子商务产业蓬勃发展的市场机遇，对原有课程体系进行不断的改革和创新。建立工学一体化课程体系是当前和未来高职电子商务专业发展的必然选择。本文首先分析了当前国内高职院校电子商务专业工学一体化课程设置的现状，进而分析高职电子商务专业工学一体化课程设置中存在的突出问题，最后提出建立全新高职电子商务专业工学一体化课程的一些建议。