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目前国内棉花人工去雄杂交制种生产大多采用委托生产的方式，即棉种经营公司不直接建立和管理生产基地，而采用将制种生产委托给专门的制种生产公司的方式，由制种生产公司独立地建立和管理制种生产基地。制种公司的制种生产管理大致可分为直管和托管两种模式，其主要区别在片区管理责任方式的不同，前者采取质量和产量与管理报酬挂勾的方式，后者则采取片区管理费用包干的形式。