【摘 要】
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为深入了解鸡NOD样受体（NLRs）家族基因特性，利用生物信息学方法通过保守结构域搜索鉴定了鸡的NLRs基因，分析NLRs基因理化性质、基因结构、系统进化关系、正选择作用、共线性关系和表达情况。结果显示：共鉴定出5个鸡NLRs基因，分别命名为chNLRC5、chNLRC3、chNLRP3、chNLRX1、chNOD1，分布在5条染色体上，编码734～1 862个氨基酸，编码蛋白相对分子质量为82
【机 构】
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河北科技师范学院河北省特色动物种质资源挖掘与创新重点实验室(筹)
【基金项目】
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河北省鸡现代种业科技创新团队优质特色燕山红玉肉鸡种质创制（21326303D-5）； 河北省现代农业产业技术体系蛋肉鸡创新团队遗传资源开发与利用岗位专家项目（HBCT2018150201）； 河北省教育厅重点项目（ZD2018034）； 秦皇岛市科学技术研究与发展计划（201903B0
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为深入了解鸡NOD样受体（NLRs）家族基因特性，利用生物信息学方法通过保守结构域搜索鉴定了鸡的NLRs基因，分析NLRs基因理化性质、基因结构、系统进化关系、正选择作用、共线性关系和表达情况。结果显示：共鉴定出5个鸡NLRs基因，分别命名为chNLRC5、chNLRC3、chNLRP3、chNLRX1、chNOD1，分布在5条染色体上，编码734～1 862个氨基酸，编码蛋白相对分子质量为82 842.01～207 969.52 ku，等电点为5.48～8.64;chNLRC5、chNOD1和chNLRP3为酸性蛋白，chNLRC3和chNLRX1蛋白呈碱性，只有chNOD1为稳定蛋白，5个成员均为亲水蛋白，5个基因结构差别显著，分别含有48、20、7、7、11个外显子；系统进化树显示，NLRs基因家族分为5个分支，鸡、绿头鸭、火鸡和日本鹌鹑NLR基因间存在较强的共线性关系；对各成员进行选择压力分析结果鉴定出13个正选择位点；鸡回肠和肺组织中检测到NLR基因表达。研究表明正选择效应在NLRX1、NOD1、NLRC5基因作用明显，NLRC5在鸡回肠和肺组织中为表达活跃的功能基因。
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