广西巴马小型猪内源性反转录B亚型病毒5′非编码区的序列扩增及分析

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应用SMART RACE方法快速扩增广西巴马小型猪内源性反转录病毒(PERV)5′非编码区,获得了一条长度为1 423 bp的PERV-5′UTR序列(GenBank登录号GU390231),该序列与GenBank已发表的PERV-A、B、C各亚型同源性分别为92.4%~95.2%、91.8%~99.5%和86.5%~92.6%,遗传进化树分析,扩增序列为B亚型PERV-5′UTR。一级结构分析表明,该序列由U3、R、U5、PBS和LEADER 5个区域构成,与GenBank已发表的其他序列相比缺少344
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