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与跨国公司相比,国内企业存在着研发水平不足、规模实力较小等问题。对于这些问题的解决,医药各子行业中的企业在总体战略上有着各自的选择方向,如：原料药企业的战略选择是通过购并等扩大规模,取得规模优势,以及加速产品仿制和开发;化学制剂药企业是模仿性创新;中药企业是在国内市场塑造知名企业品牌或者产品品牌,在国际市场推动中药规范化;生物制药企业是购买专利和加大研发投入。