2006-2007年云南流行H9N2禽流感病毒血凝素全基因序列分析

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为调查云南省H9N2亚型禽流感病毒的分子流行病学情况,对2006年6月至2007年4月从云南省16地州随机采集了各种家禽、家猪的5728份喉气管和口腔棉拭子样品进行RT—PCR检测,276份样品呈H9N2阳性。将具有代表性的17份阳性样品的HA全长基因序列测定和分析。结果表明:株间HA基因同源性为91%~100%,推导氨基酸同源性95%~1。0%,所测序列与云南1999年分离H9N2毒株ackynkenxie-1-99的同源性仅为93%。根据HA基因同源性,可将17个毒株可分为2个亚群,一个亚群的12株H
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