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由于很多实验结果不能通过传统的mPTP模型得到圆满的解释,最近人们逐渐接受一些新的假说:线粒体内膜存在两种PT孔道--可调控的PT孔道(regulated PT pores)和不可调控的PT孔道(unregulated PT pores),兼性蛋白簇集、CYPD及其他未明确的分子伴侣复合体构成可调控的PT孔道,当兼性蛋白簇集大量生成,分子伴侣不足以抑制其开放时,线粒体PT孔道由可调控状态变为不可调控状态。