【摘 要】
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【目的】子预44是一具有广谱持久稻瘟病抗性的云南地方粳稻品种。为了鉴定子预44中候选稻瘟病抗性相关基因,【方法】本研究利用高通量测序技术(High-throughput sequencing)
【机 构】
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云南农业大学农业生物多样性与病虫害控制教育部重点实验室/省部共建云南生物资源保护与利用国家重点实验室
【基金项目】
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国家重点研发计划资助项目(2016YFD0100600);国家自然科学基金资助项目(31160223);云南省高校科技创新团队支持计划资助项目(IRTSTYN)
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【目的】子预44是一具有广谱持久稻瘟病抗性的云南地方粳稻品种。为了鉴定子预44中候选稻瘟病抗性相关基因,【方法】本研究利用高通量测序技术(High-throughput sequencing)对子预44和感病水稻江南香糯进行了全基因组测序。而后使用软件GATK(3.4-46)对高质量测序结果进行SNP和InDel的检测和统计,进一步筛选出子预44和江南香糯DNA水平存在SNPs/InDels多态性抗病相关基因。【结果】通过HiseqX10 PE150平台分别获得了4118170045 bp和2995054
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