卡那霉素A与腺嘌呤间氢键作用位点的研究

来源 :辽宁师范大学学报:自然科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户：xiaoshen1984

【摘要】

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采用B3LYP/6-31+G(d,p)方法优化得到了卡那霉素A的简化模型与腺嘌呤形成的9个氢键复合物的稳定结构,并在M06-2X-D3/aug-cc-pVDZ水平下分析该类复合物分子在气相、蛋白相和水

【作者】

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黄翠英姜笑楠王萌

【机构】

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辽宁师范大学化学化工学院

【出处】

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辽宁师范大学学报:自然科学版

【发表日期】

：

2020年4期

【关键词】

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卡那霉素A 腺嘌呤氢键作用作用位点相互作用能 Kanamycin A adenine hydrogen bonding interaction inter

【基金项目】

：

辽宁省教育厅青年项目(L201683671)

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采用B3LYP/6-31+G(d,p)方法优化得到了卡那霉素A的简化模型与腺嘌呤形成的9个氢键复合物的稳定结构,并在M06-2X-D3/aug-cc-pVDZ水平下分析该类复合物分子在气相、蛋白相和水相中的相互作用能.研究结果表明,卡那霉素A使用3号位点与碱基形成的氢键复合物更稳定;腺嘌呤则倾向使用3号位点与卡那霉素A形成氢键复合物.同时研究了卡那霉素A各位点的质子化和去质子化反应焓变,发现这些结果可作为卡那霉素A不同位点氢键复合物相对稳定性的推断依据.

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