【摘 要】
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目的 基于一系列计算生物信息学方法,探索TEM β-内酰胺酶突变导致的构象变构与抗生素耐药性的关系.方法 首先,采用直接耦合分析方法,预测TEM结构中决定其构象的直接和间接的
【机 构】
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兰州大学药学院,兰州市食品药品检验所
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目的 基于一系列计算生物信息学方法,探索TEM β-内酰胺酶突变导致的构象变构与抗生素耐药性的关系.方法 首先,采用直接耦合分析方法,预测TEM结构中决定其构象的直接和间接的强耦合残基对;其次,采用分子动力学模拟和蛋白质构象阻挫分析方法分析耐药性突变残基参与的耦合残基对在蛋白质构象变化中的作用;最后,采用蛋白质成药性结合位点预测方法Fd-DCA,预测TEM表面潜在的成药性变构位点.结果 通过共耦合分析方法发现238-环结构域与Ω-环结构域内部或结构域之间,以及TEM-52的突变残基E104K、G238S和
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