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针对中国超临界水冷堆（CSR1000）建立堆芯数学模型，开发基于频域法的超临界水冷堆流动不稳定性分析程序FREDO-CSR1000和基于时域法的超临界水冷堆流动不稳定性分析程序TIMDO。对程序进行初步验证后，使用其对CSR1000堆芯进行流动不稳定性分析计算，计算结果显示由频域法和时域法计算得到的稳定性边界图都明显分成2个区域，呈现倾斜的双L型，明显存在2个拐点，分别对应流量漂移和密度波振荡2种流动不稳定性现象。2种方法计算得到的CSR1000运行点都处于安全运行空间内，距离流动不稳定性边界较远。