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运用协同理论及系统协调分析方法建立协调度模型，对2004—2016年高等教育学科结构与就业结构系统进行协调度综合评价及协调发展趋势分析。结果表明：高等教育学科结构较之就业结构对协调度的影响更大，系统之间协调度经历了不断上升、突然下降再平缓上升3个阶段，并最终朝着协调度稳步提升态势发展。但协调程度普遍偏低且系统的协调度更加依赖高等教育学科结构。因此可从建立学科专业监测预警机制、鼓励高校设置与第三产业相关的学科专业、扩大高校学科专业设置和结构调整自主权、注重发展学科专业内涵4个方面促进高等教育学科结构与就业结构的协调发展。