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金针菇为好气性真菌,在代谢过程中需要不断吸收新鲜空气.金针菇在催蕾期和子实体生长前期需要消耗大量的氧气,特别是在大量栽培时,当空气中二氧化碳浓度超过0.6％,子实体和菌盖的发育就会受到抑制.但在子实体长到4厘米高时,则需要控制菇棚内的氧气含量,此后若菇棚内氧气含量较高,金针菇菇柄短,菇帽容易开伞.