使用HSMMs模型的蛋白质二级结构预测

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文章对隐式半马科夫链模型(HSMMs)[1]进行了研究,并提出利用残基片段的疏水相互作用概率函数.此参数模型可以认为是片段简明网络的扩展,它通过获取残基序列的相互依赖关系来建立.使用该模型可克服传统预测方法在无同源家族蛋白时的预测困难,对靶蛋白质的同源性要求不高.
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