辐照后非小细胞肺癌差异表达基因的生物信息学分析

来源 :辐射研究与辐射工艺学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:chinesechinese123456
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为了探讨辐射对非小细胞肺癌(NSCLC)lncRNA基因表达的影响,我们从GEO数据库中检索获得非小细胞肺癌辐照反应后Y染色体lncRNA基因表达谱数据芯片“GSE147708”,并进行多个在线数据库分析。利用GEO2R筛选差异表达基因;DAVID在线工具进行GO和KEGG富集分析;String在线网站构建蛋白互作网络,然后利用Cytoscape软件获取核心基因;通过GEPIA在线工具结合TCGA数据进行预后价值分析。共筛选获得上调表达基因23个,下调表达基因28个,通过构建蛋白网络获得了前20个核心基因
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