当代医学已从分子治疗向细胞治疗过渡。干细胞治疗对一些重大疾病(糖尿病、中风、心肌梗死、肿瘤等)具有明显疗效,但是现有干细胞治疗方法还存在一些问题。缺乏统一的干细胞分类和鉴定方法以及干细胞制剂质量标准;质量合格的干细胞制剂数量不足;干细胞制剂具有适应证和禁忌证;干细胞治疗需要筛选患者,进行长期随访;此外,近年来干细胞研究和应用还发现其他一些问题,如依赖现象、违规治疗现象等。针对这些问题,提出了一些解决方法和应对策略。未来,随着干细胞治疗管理模式的转变,细胞水平的治疗将向组织水平的治疗发展。通过干细胞技术和组织工程技术融合发展起来的原位治疗,将是干细胞治疗发展的重要方向。利用干细胞活性成分(细胞因子等)或亚单位(囊泡或外泌体)进行治疗,是今后干细胞治疗发展的另一个方向。