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SSR和ISSR分子标记技术是近几年发展起来的、以PCR为基础的DNA多态性检测技术,具有稳定性好、多态性丰富、遗传信息量大等优点,目前已广泛应用于各个领域.本文主要概述了SSR和ISSR分子标记的原理和特点,及其在海洋贝类种群遗传多样性、群体遗传结构分析、亲缘关系及杂交子代鉴别、遗传图谱构建、种质资源评价与保护等研究领域中的应用.