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为了提高脉冲星辐射信号的信噪比，提出了一种基于经验模态分解（EMD）的脉冲星信号去噪算法。利用经验模态分解将信号分解为一组固有模态函数（IMF）。针对EMD阈值消噪算法性能不稳定这一问题，该算法滤除固有模态函数噪声时，利用相邻信号标准差作为噪声水平的判断准则，并采用自适应阈值，对于噪声含量较高的信号采用低通滤波器消噪。实验结果表明，与EMD阈值消噪方法相比，该算法能获得更高的信噪比，并具有较好的稳定性。