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目的 分析类风湿关节炎(RA)患者滑膜环瓜氨酸肽(CCP)表位表达情况与HLA-DRB1共同表位(SE)等位基因、肽酰基精氨酸脱亚氨酶4(PADI4)基因单核苷酸多态性(SNPs)的相关性.方法 对象为2008年10月至2011年12月对内蒙古医学院附属医院风湿免疫科和骨科的53例RA患者和42例对照组患者(外伤者26例,骨关节炎16例).抗CCP单链抗体(ScFv)通过噬菌体蛋白展示技术构建.以6×His- Tag免疫组化法检测RA关节滑膜的CCP表达情况.PADI4基因SNP通过逆转录合成cDNA测序,杂合子TA载体克隆测序.序列特异性引物PCR( SSP-PCR)法检测HLA-DRB1等位基因型.结果 CCP表位在RA组与对照组表达率分别为77.4%和9.5%,差异有统计学意义(P<0.01).RA组2个PADI4 SNP基因型(PADI4_89 G+和PADM_104T+)的频率与对照组相比差异有统计学意义(P<0.05).携带这2个少见基因型者较常见基因型发生RA的危险性为3.67和2.53倍.携带SE+等位基因型者较SE-者发生RA的危险性为5.57倍.RA滑膜CCP表位表达仅与SE+等位基因型和PADI4_89 G+、PADI4_104T+以及两者同时阳性相关.血清CCP滴度与SE+、PADI4_104T+ G+,SE +/PADB_89 G+和SE+/PADM 104T+等基因型相关.结论 RA患者滑膜CCP表位表达和抗CCP抗体的产生与特定的SE等位基因型和PADI4基因SNP密切相关。