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20世纪90年代以来,随着国家、社会对水环境质量的日益关注,水生植物这一小众的生态类群在我国受到了越来越多的重视。从水生植物多样性编目、面临的危胁(湿地退化、水体富营养化、全球气候变暖、外来物种入侵)、相关的基础性研究(遗传多样性、土壤种子库、种子活力)和保护实践(自然保护区、种质资源库)等方面,对20世纪90年代以来的水生植物多样性研究工作进行梳理与展望,以期为后续更好的保护提供建议。