大白菜生长素受体基因家族生物信息学鉴定与表达分析

来源 :云南农业大学学报:自然科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户：piglolo1987

【摘要】

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【目的】对大白菜生长素受体BrTIR1/AFBs基因家族进行系统分析,为大白菜BrTIR1/AFBs基因家族的功能挖掘和性状遗传改良提供理论依据。【方法】利用生物信息学方法,分析大白菜

【作者】

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代真林张荣琴杨俊张晋豪魏兰芳刘棋姬广海

【机构】

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云南农业大学,云南农业大学

【出处】

：

云南农业大学学报:自然科学版

【发表日期】

：

2020年6期

【关键词】

：

大白菜生长素受体基因家族全基因组鉴定顺势作用元件表达谱 Chinese cabbageauxin receptor gene familygenome-

【基金项目】

：

国家重点研发计划项目(2019YFD1002000),云南省农业联合重点项目[2017FG001(−005)],云南省重点研发(农业领域)计划项目(2018BB016)

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【目的】对大白菜生长素受体BrTIR1/AFBs基因家族进行系统分析,为大白菜BrTIR1/AFBs基因家族的功能挖掘和性状遗传改良提供理论依据。【方法】利用生物信息学方法,分析大白菜生长素受体基因家族的进化关系、编码蛋白、保守结构域和顺式作用元件。基于NCBI转录组测序(RNA-sep)数据,分析BrTIR1/AFBs基因家族在大白菜不同组织中的表达模式以及在根肿病入侵条件下的表达情况。【结果】从大白菜基因组数据库中鉴定得到10个BrTIR1/AFBs基因。拟南芥、茎瘤芥和大豆生长素受体基因家族多序列比

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