声门上喉癌的染色体异常和重要相关基因的研究

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目的 筛查声门上喉癌发生、发展及转移相关的异常染色体和重要基因. 方法应用比较基因组杂交(comparative genomic hybridization, CGH)分析喉声门上鳞状细胞癌(laryngeal squamous cell cancer, LSCC)癌组织和癌旁组织DNA拷贝数的差异.应用cDNA芯片结合聚类分析研究喉声门上癌癌旁组织、癌组织和转移淋巴组织中差异表达的基因.结果 CGH结果表明每例喉癌平均涉及12.9个染色体的异常,其中出现高频率扩增的染色体区集中在3q15-21 (14/18)、5p12-13 (11/18)、8q22-24 (6/18)、11q12-13 (8/18)、15q21-23 (7/18) and 18p11 (8/18),而高频率缺失的染色体区集中在1p13-21 (8/18)、3p21-23 (14/18)、5q21-22 (14/18)、9p12-pter (11/18) and 13q21-31 (8/18).聚类分析将表达差异的基因分为3组.表达差异在5倍以上的基因12个,在由癌旁至癌阶段、癌至转移阶段均存在表达异常的基因3个.这15个重要基因是喉癌新的相关基因,其中4个基因cytochrome C oxidase Ⅴa, PPBP, EPHX2 andPON1与喉癌相关性的研究未见报道,而且,SH3GL2位于高频率缺失的染色体区9p12-pter.结论我们发现的特异染色体区和重要基因将为喉癌发生、发展和转移的研究提供重要线索.

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