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选用17条ISSR引物分析12份臂形草种质遗传差异，结果表明：臂形草种质间的多态性高，17条引物产生了286条DNA片段，其中280条具有多态性，多态性比率高达97．90％；每个引物可扩增出6-23条DNA片段，平均16．8条，种质间遗传相似系数变化范围为0．486～0．968，平均值为0．681；通过聚类分析可将12份臂形草种质分为两类：一类为巴拉草和湿生臂形草，其余品种则聚为另一类。