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目的：探究不同剂量万古霉素治疗小儿耐甲氧西林金黄色葡萄球菌肺炎（MRSA）的临床疗效。方法：实验开始前，于我院儿科中选取72例被确诊为MRSA肺炎的患儿作为实验研究对象，经医师诊断及确诊，需采用万古霉素治疗，为探究不同剂量万古霉素对该病症的治疗效果，采用双盲法将72例患儿随机分配为对照组和观察组，对照组应用小剂量万古霉素，观察组则应用高剂量，对比不同剂量下的临床疗效。结果：据实验结果来看，应用高剂量万古霉素的观察组MRSA肺炎患儿，包括15例显效，19例有效，2例无效，治疗有效率94.44%；反观应用低剂量万古霉素的对照组13例显效，17例有效，6例无效，治疗有效率83.33%，对比来看观察组治疗有效率明显高于对照组，（P＜0.05）。其次，观察组患儿的万古霉素用药达预计浓度占比、MRSA清除率以及不良反应发生率均显著优于对照组，数据间存在统计学意义，（P＜0.05）。结论：对MRSA肺炎患儿实施高剂量万古霉素治疗，可高效清除甲氧西林金黄色葡萄球菌，对促进患者更快康复有重要作用。