9株猪圆环病毒Ⅱ型流行毒株全基因组克隆及序列分析

来源 :广西农业生物科学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zhangstian
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参考GenBank上发表的猪圆环病毒Ⅱ型(porcine circovirus 2 ,PCV2)全基因组序列,设计一对引物,通过反向PCR技术扩增出9株PCV2流行株的全基因,并进行了序列测定与分析,结果表明:9株PCV2的基因组全长为1 768 bp或1 767 bp,同源性比较发现,本研究的9株PCV2之间的核苷酸同源性为95.6%~100%,与GenBank上已发表的PCV2分离株之间的同源性为95.1%~99.8%,与法国和新西兰代表株的亲缘关系较近,与美国、加拿大和澳大利亚代表株的亲缘关系较远.所得9株PCV2的ORF2核苷酸及其所推导的氨基酸序列同源性分别为93.1%~100%和91.8%~99.6%,存在较大的变异.
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