【摘 要】
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基于多核平台设计了一个求解多序列比对问题的改进遗传算法。该算法采用一致性函数作为个体的适应度函数,引进小生境技术,维持种群进化的多样性,以改善算法的整体搜索能力。
【机 构】
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长江大学工程技术学院,海南大学信息科学技术学院
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基于多核平台设计了一个求解多序列比对问题的改进遗传算法。该算法采用一致性函数作为个体的适应度函数,引进小生境技术,维持种群进化的多样性,以改善算法的整体搜索能力。考虑遗传算法本身具有较好的并行性,对其各算子针对多核平台进行了并行化设计。通过对BAliBASE中的测试例进行测试,与已有的算法相比取得了更优的结果,证明该算法是有效的。并行化设计使算法在多核平台的运行时间显著缩短,加速效果明显。
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