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道地中药材茅苍术具有广泛的形态多样性。为了识别其遗传多样性，应用ISSR分子标记技术对16个茅苍术基因组和4个北苍术基因组进行了多态性分析。结果发现，茅苍术ISSR多态位点百分率为87．67％，北苍术ISSR多态位点百分率为53．33％，证明茅苍术比北苍术有更高的遗传多样性。采用SPSS13．0软件的Within-group linkage法对20个样品进行聚类分析。结果表明，茅苍术具有明显的遗传分化，且与北苍术有很近的亲缘关系。