柯萨奇病毒B5基因组进化存在结构蛋白编码区VP4的重组

来源 :国际检验医学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户：ilfang456

【摘要】

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目的重组是肠道病毒进化的重要机制,大多数重组事件发生在包括P2和P3的肠道病毒的非编码区中,但是在埃可病毒30株中首次发现了作为蛋白质编码区的VP4区域中的重组,本研究旨在

【作者】

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答嵘王伟

【机构】

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西安交通大学第一附属医院检验科,西安交通大学第一附属医院神经外科

【出处】

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国际检验医学杂志

【发表日期】

：

2019年23期

【关键词】

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柯萨奇病毒B5 基因重组系统发育分析 Coxsackievirus B5recombinationphylogeny

【基金项目】

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陕西省自然科学基础研究计划项目一般项目(面上)(2019JM-445),西安交通大学第一附属医院新医疗新技术项目(XJYFY-2016j5)

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目的重组是肠道病毒进化的重要机制,大多数重组事件发生在包括P2和P3的肠道病毒的非编码区中,但是在埃可病毒30株中首次发现了作为蛋白质编码区的VP4区域中的重组,本研究旨在探讨柯萨奇病毒B5(CVB5)中是否存在类似的重组事件。方法从GenBank中检索CVB5的核苷酸序列,分别在5′UTR和VP1区域中进行系统发育分析。此外,跨越5′UTR-VP4-5′VP2的部分基因组用于检测重组并使用序列相似性作图(Similarity plot)来分析重组体。结果5′UTR和VP1系统发育树显示5′UTR和VP1

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