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从蛋白质序列出发,我们首先将每条蛋白质序列分成等长的15段得到离散增量值、低频功率谱密度值、N端和C端的打分值和模体频数构成的组合向量表示蛋白质序列信息,用随机森林算法,对氧化还原酶、转移酶、水解酶、裂解酶、异构酶和连接酶中包含的亚类分别进行分类预测.总精度依次为90.86％、95.24％、96.42％、98.60％、97.53％和98.03％.除转移酶和水解酶略低于前人,其余好于前人的预测结果.