【摘 要】
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对北京昌平地区分离的9株犬细小病毒(Canine parvovirus,CPV)进行VP2基因克隆测序,并利用生物信息学软件,将克隆的VP2基因与GenBank公布的国内外部分毒株序列相比较,绘制系统进
【机 构】
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中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,河北北方学院动物科技学院,军事医学科学院放射与辐射医学研究所
【基金项目】
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中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金资助项目(2010JS-2 2009QN-3 0032007008), 北京市科委基金资助项目(Z07010501780701)
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对北京昌平地区分离的9株犬细小病毒(Canine parvovirus,CPV)进行VP2基因克隆测序,并利用生物信息学软件,将克隆的VP2基因与GenBank公布的国内外部分毒株序列相比较,绘制系统进化树,分析9株CPV VP2蛋白亲水性和抗原指数。结果表明,分离毒株与参考毒株核苷酸和氨基酸同源率在97%以上。通过序列比对与分析,确定其中有8株为New CPV-2a,1株为CPV-2,表明该地区目前主要以New CPV-2a流行为主。9株分离株在进化树上都能找到亲缘关系较近的毒株,没有形成新的分支。9株
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