成都地区犬细小病毒VP2基因克隆分析及基因型鉴定

来源 :中国畜牧兽医 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jk0803liuyan
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根据GenBank中犬细小病毒(canine parvovirus,CPV)VP2基因序列设计合成两对特异性引物1F/1R和2F/2R,从疑似_CPV感染病犬的粪便病料中提取DNA作为模板,分段扩增涵盖VP2基因的两个片段,大小分别为1325和758 bp,并进行克隆、测序,通过拼接得到11条长度为1755 bp的VP2基因完整序列.核苷酸同源性分析表明,扩增得到的11个完整VP2基因序列与GenBank中发布的21株国内外参考毒株比较,核苷酸同源性为96.2%~99.8%.采用DNAStar软件分析,预测VP2蛋白可能成为B细胞表位的区段位于Metl-Va138、Met73-Va182、Met96-Ala103、Lys 151-Thr170、Gly235-Phe243、Leu294-Phe303、Ala359-Thr399 、Ile469-His483、Ala503-Arg520、Lys570-Tyr584.将扩增获得的VP2基因编码的氨基酸序列与CPV参考毒株进行比较,第426位和第555位氨基酸残基分别为Asp和Val,鉴定出本试验得到的CPV基因型均为2a型,初步证实成都地区仍以CPV-2a为主要流行毒株.
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