美国9·11事件之后，北约海军执行任务的海域已经扩展到海湾地区的海上通道和非洲海岸，在这些地区，要和全世界的恐怖主义以及潜在的暗杀活动作斗争。为了应对新的形势和任务，作为北约成员国的德国，也于2003年成立了营一级的小军种——海军蛙人特种部队(SEKM，德文为Spezialisierte Einsatzkrafte der Marine)。
　　二战后的德国海军没有值得一提的两栖作战战例。在北约和华约的冲突中，几乎不存在德国登陆部队参与行动的可能。现在的海军蛙人特种部队虽然规模不大，人数不多，但却是德军海上反恐的精锐。他们的任务是捕获可疑船只，所使用的武器几乎全部是轻武器。
　　
　　使命
　　
　　自从1960年代以来，对西方工业国形成威胁的已经不再是来自东方的假想敌，而是完全新型并且现实的敌人，这就是来自中东和近东地区一些国家的激进主义分子，他们为了满足自己的需要，不时地劫持飞机和船只。新的国际恐怖主义分子对西方世界破坏最严重的地点和物资是：石油交货地、油轮、渡船和港口。美国海军的海豹突击队(SEAL)和英国皇家海军突击队的“科曼奇小组”，就承担着反恐任务。在荷兰，王室“海军 (Marinier)”的特种部队甚至被提升为应对突发恐怖事件的国家反恐部队。在德国，第９边防大队(GSG9)建立了一支海军分队，蛙人特种部队也归至旗下。
　　
　　9·11恐怖袭击事件之后，各国对航空监督日趋严格，而通过海上通道对工业国家造成威胁存在更大可能性。对美国Cole驱逐舰或者法国Limburg油轮的袭击表明，这类袭击行动很容易奏效。为此，也要求德国海军蛙人特种部队改变作战方式，以适应德军将来到本地区以外去执行任务。
　　近十几年，德国海军多次被派往海外执行任务。1992年，德国海军的蛙人特种部队参加了在亚得里亚海名为“机敏警戒”的禁运行动。1992年1月底，德国 “默尔德”驱逐舰在亚得里亚海域拦截了“戈得温德”号货船，引发了一个人人皆知的爆炸性新闻：从船上搜出了由当时的捷克斯洛伐克非法运往叙利亚的16辆 T72坦克。在围绕前南斯拉夫的冲突中，德国海军首次奉北约之命在海上进行检查和封锁。随着阿富汗战争的开展，德国海军被分派了监视亚、非之间的海上通道任务。
　　从2002年初开始，由美国指挥的吉布提行动得到了德国海军的支持。当美国指挥部将它的海豹突击队派遣到阿富汗兴都库什山追捕恐怖主义分子的时候，德国海军为海上行动派遣了蛙人和排雷兵。为完成行动，德国海军进行了多种战术演练。这些作战模式只有按照北约所说的“联合状态下共同行动”才能成功，也就是说要采取国际性的跨军种联合行动。
　　
　　这种军种混编模式除了应对当前的反恐作战外，还可能成为今后应对地区冲突的主流，其中海军蛙人特种部队将发挥重要作用。
　　
　　改革
　　
　　在德国联邦国防军的所有部队中，海军可能是迄今改革最彻底的军种，其中包括拥有高技术装备的海上精兵——海军特种部队。这支精干部队具有革新精神和灵活机动性。同联邦国防军的其他部队不一样，它不光是“破”，而且还 “立”，就是说解散一部分，又建立一部分。例如，成立不到一年半的海军蛙人特种部队现在已经具备了精锐步兵的能力，而这些精锐队员以往分散在蛙人部队或海军警戒部队中。为了在将来和友邻部队联合行动，联邦国防部于2004年9月1日成立了有三军参加的“特种兵作战处”。按照国防部的计划，从2005年起，特种兵作战处在作战指挥一级，成立自己的“特种兵指挥部”，独立组织整个特种作战行动。为此，海军特种兵与通常被冷落的海上警卫部队和蛙人特种部队联合，以便在未来能应对日趋复杂的海上特种作战行动和遂行特殊任务。
　　新的特种部队除了编有指挥部和后勤排以外，还拥有强行登艇连，目前有一部分队员正参与在吉布提的非洲海角“150部队”（国际海上部队）的 “永久自由”行动。
　　
　　现在，德国海军蛙人特种部队在亚丁和南非之间的敏感海上通道，对可疑船只，由过去的友好指控登船变为进攻性地强行登船。一般先通过无线电台问话，随后立即派一个小组突然上船，核查该船的出发地点、有关文件、所载货物和船员，发现可疑，立即扣留，同时搜查武器和人员。
　　在美国海军指挥中心(USNAVCENT)领导的“永久自由”行动中，奥格斯堡驱逐舰2004年强行登船检查８次，而它的前任吕贝克驱逐舰，在同一作战区域，６个月登船检查达11次。这样的登船检查行动都是得到当地驻防部队允许的。通常是12名登船士兵乘坐“海山猫”MK88A直升机分２组登船，或者乘快艇从海上登船。每架直升机上都配有机炮，以及AN-M3式12.7mm航空机枪。
　　
　　装备
　　
　　强行登船检查是海军蛙人特种部队第一连的任务。该部队不仅配备了攀钩和缆绳，还装备了HK公司的P8C手枪和G36短步枪。海军特种部队第二连接受过步兵特殊训练，并配有许多通信器材。在海上行动中，他们从陆地或海上支援其他特种部队，特别是在掩护德国居民撤退的时候。因此这支部队也装备使用0.300英寸温彻斯特马格努姆枪弹的G22狙击步枪，并配备机枪，供队员在紧急情况下备用，以及在偷越封锁线或撤离平民时供守卫桥头堡的小组进行火力支援。
　　
　　在海军蛙人特种部队的框架内，蛙人连分成３个战斗队。他们可以利用降落伞空降或者从潜在海底的潜艇鱼雷发射管中到达他们的目的地。在他们的军械库里储存有包括德国在内的各国武器，例如非常保密的P11水下手枪。该枪是HK公司研制的，由枪管束组成，采用电击发方式，能在水下发射数枚箭形弹。蛙人还配有一系列MP5冲锋枪的变型枪及其附件，如休·费尔战术灯、激光指示器等。其他“秘密”武器有西格-绍尔公司和HK公司的自动手枪，AK47、 AKM(S)和AK(S)74突击步枪，雷明顿M700霰弹枪和HK502霰弹枪。许多蛙人都是训练有素的狙击手。起初他们选用的是PSG1狙击步枪，后也使用麦克米伦M93式12.7mm大口径狙击步枪，以及英国国际精密仪器公司的G22和G24 狙击步枪。此外还有瑞士的SIG541突击步枪，甚至还有各种各样的双管猎枪。
　　海军蛙人特种部队的扫雷连编有2个排，他们的任务是摧毁海面和水深 54m以内的各种战斗器材。其中一个排负责在三军联合作战行动中清除陆地和浅水区的战斗器材。扫雷连的训练包括扫雷训练，游泳训练，以及在游泳中射击、爆破、强行登船。作为训练平台，除了陆地或室内训练以外，那就是用 “Langeoog”、“Muehlhausen”这2艘老式的武装潜水艇训练。
　　海军特种部队最突出之处就是卓越的集体技能和极强的环境适应性。他们与盟军合作，出色地进行非对称战争。