基于微RNA-mRNA调控网络对草酸钙肾结石形成关键分子的筛选和分析

来源 :海军军医大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:guannipishiwori
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的 应用生物信息学技术构建草酸钙肾结石大鼠miRNA-mRNA调控网络并筛选出调控草酸钙肾结石形成的关键分子。方法 从基因表达汇编(GEO)数据库中筛选出乙二醇喂养14 d诱导的草酸钙肾结石大鼠肾组织的miRNA和mRNA数据集,利用GEO2R在线工具分析得到差异表达miRNA(DEM)和差异表达基因(DEG),并用热图进行展示。利用在线靶基因预测工具miRWalker预测DEM的靶基因,根据miRNA负向调控mRNA原理应用R语言“venn.diagram”包与DEG取交集,得到参与调控草酸钙肾结石形成的基因,然后应用“clusterprofile”包对调控基因进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,利用String数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络分析,利用Cytoscape软件实现对PPI和miRNA-mRNA调控网络可视化和关键基因的筛选。结果 共分析得到38个DEM和364个DEG。将预测得到的DEM靶基因与DEG取交集后得到116个调控基因,这些基因富集在24个GO条目和22个KEGG信号通路中。成功构建了miRNA-mRNA调控网络,处于核心调控位置的miRNA为mi RNA-6215、miRNA-758-5p和miRNA-214-3p。PPI网络分析筛选出5个关键基因,分别为叉头框转录因子M1(Foxm1)、核分裂周期蛋白80(Ndc80)、细胞周期蛋白依赖性激酶抑制因子2B(Cdkn2b)、Cdc10依赖性转录因子1(Cdt1)和B细胞编码κ轻链多肽抑制基因(Ikbkg)。结论 通过构建miRNA-mRNA调控网络,筛选出在草酸钙肾结石形成过程中起关键调控作用的miRNA和基因,为草酸钙结石的防治提供了新的研究思路。
其他文献
阐述基于人体睡眠周期规律的睡眠环境自动调节系统的设计,系统通过ZigBee无线传感器网络采集人体睡眠期间的心率与卧室的环境相关信息,将环境温、湿度值作为模糊控制器的输入量,建立模糊“解耦”控制规则库,输出控制指令,对控制环境的多个电器实施无线分布式同步控制,调节出适合个性化的高质量睡眠环境条件。
期刊
金融科技平台始终面临着一道定性难题:销售抑或广告。如果跳出传统属性界定的概念藩篱,回归“防控风险”的金融法核心要义,则不难发现“风险导入和风险控制”构成平台定性的两大实质要件。由此观之,金融科技平台因主导智能推介、账户关联、版式设计、佣金分成以及品牌混同等多项业务,而呈现风险导入性更强、控制力更高的销售化趋向。因此,针对金融科技平台的行为规制,除了在主体层面应将适当性义务提升至平台一级,而非转嫁至
期刊
肩周炎是导致肩部疼痛和活动受限的疾病,糖尿病患者是易患肩周炎的高风险人群,症状更严重,双侧受累多见,严重影响生活质量。手术治疗风险高且易复发,因此保守治疗在临床上值得推广。本文结合国内外文献对糖尿病合并肩周炎患者的保守治疗方法、疗效及安全性等方面的研究进展作一综述,旨在为糖尿病合并肩周炎患者的保守治疗提供循证依据。
期刊
<正>一、肩膀疼痛与肩周炎肩膀疼痛大致可以分为三种:1.肩关节不稳引起的疼痛。如有些人本身肩关节松弛或者有过肩关节外伤、肩关节脱位等疾病史,疼痛以外还会感觉到肩关节比较松,甚至在做某些动作时有要脱位的恐惧感。2.肩关节发生粘连引起的疼痛。这种疼痛往往早期比较严重,逐渐会出现肩关节活动幅度变小,乃至肩关节僵硬等症状。
期刊
探究式学习打破了传统教学对学生的桎梏,体现了“以人为本”的素质教育理念。探究式学习5E模式中的吸引、探索、解释、加工和评价这五个阶段有利于培养学生的独立思考和创新能力,以及自主探究意识;从教学层面来看,也极大程度上提升了教学效率,强化了教学效果,弥补了传统英语阅读课堂的不足。基于此,本文将结合真实课例,对探究式学习5E模式在初中英语阅读教学中的应用进行探索。
期刊
目的:观察冻干重组人脑利钠肽(新活素)联合左西孟旦注射液对老年急性心力衰竭患者心功能及血清学指标的影响。方法:选择老年急性心力衰竭患者96例,随机分为对照组和观察组,每组48例。在常规治疗基础上,对照组采用左西孟旦注射液治疗,观察组采用左西孟旦注射液联合新活素治疗。比较两组患者治疗前、治疗7d后心功能指标[左心室短轴缩短率(FS)、左心室舒张末期内径(LVEDD)、左心室射血分数(LVEF)]、血
期刊
为解决当前建筑工程施工现场管控效果不符合实际要求问题,开展对管控重要性及措施的研究。通过建立基于6S的施工现场管控结构框架、建筑工程施工现场3D模拟及合理布置、基于监控摄像头的施工现场全面监控,提出一种全新的管控方法。通过工程项目应用分析证明,新的管控方法在应用到真实建筑工程项目当中可实现对现场的有效管控,保障施工现场的施工安全、施工质量以及施工进度。
期刊
目的 分析重组人脑利钠肽辅助治疗老年心力衰竭患者的疗效及其对心功能、炎性指标的影响。方法 76例老年心力衰竭患者,随机分为观察组和对照组,每组38例。两组患者均给予常规治疗,观察组患者在常规治疗基础上应用重组人脑利钠肽治疗。比较两组患者的临床疗效及治疗前后的心功能[左心室射血分数(LVEF)、左心室舒张末期内径(LVEDD)和左心室收缩末期内径(LVESD)]及炎性指标[超敏C反应蛋白(hs-CR
期刊
本文针对 “智慧海洋”建设过程中缺乏及时高效、高分辨率的海洋实时观测手段问题,研究无人机自主空投布放、大规模分布式随机接入、大并发物联信号全概率检测接收等关键技术,构建基于无人布设的海洋环境数据远程自主监测系统,以期大幅提升海洋环境实时信息获取能力,加速推进“智慧战场”环境保障能力建设。
期刊
为获取海上目标和海洋环境实测数据,设计了基于海上养殖设施的目标与环境监测系统。利用目标与环境监测传感器,集成数据采集、传输、处理等技术,实现目标声、光、电磁等特性和温度、盐度、海底地形地貌等环境信息的监测。
期刊