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藻类在污水处理中起着复杂的作用:既可以氧化分解有机物、降低氮磷浓度;可以富集有机污染物、金属离子、微量元素、放射性元素;可以作为肥料、饵料、食品甚至保健品;又可以作为检测的方法或监测的指标;大量繁殖可能引起"水华"、"赤潮".用藻类监测和净化污水是一种廉价高效易操作的方式.回收的藻类,尤其是螺旋藻,还可以带来巨大的经济价值.