【摘 要】
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目的 通过对致病性钩端螺旋体(简称钩体)多位点序列分型(MLST)分析,了解国内与全球致病性钩体种群结构及其分子进化.方法 应用16SrRNA基因测序和MLST分析方法对不同来源、不同时期国内钩体分离菌株与国际参考菌株进行分析,并与国内7株疫苗株结果平行比较,同时收集已公开的来自不同国家和不同时期1 238株致病性钩体的基因种与MLST数据进行种群结构分析.结果 16SrRNA基因测序分析结果显示7株钩体国际参考菌株和47株国内菌株基因种主要为问号基因种,分别占比71.4％和59.6％.7株国际参考菌株呈
【机 构】
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中国食品药品检定研究院卫生部生物技术产品检定方法及其标准化重点实验室,北京 102629
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目的 通过对致病性钩端螺旋体(简称钩体)多位点序列分型(MLST)分析,了解国内与全球致病性钩体种群结构及其分子进化.方法 应用16SrRNA基因测序和MLST分析方法对不同来源、不同时期国内钩体分离菌株与国际参考菌株进行分析,并与国内7株疫苗株结果平行比较,同时收集已公开的来自不同国家和不同时期1 238株致病性钩体的基因种与MLST数据进行种群结构分析.结果 16SrRNA基因测序分析结果显示7株钩体国际参考菌株和47株国内菌株基因种主要为问号基因种,分别占比71.4％和59.6％.7株国际参考菌株呈现7种不同ST型.而在47株中国钩体分离株中,发现15种ST型及24种尚未报道的新ST型.MLST聚类分析发现问号、波氏和卫氏基因种菌株均各自形成单独分支.7株不同ST的疫苗株也位于问号基因种内不同亚分支中.系统发育进化树表明世界范围内近百年分离的1 238株钩体菌株主要包括16个进化簇,分别为ST17、ST34、ST149、ST1和ST37等,而中国236株钩体菌株可分为4个主要进化簇,主要流行基因型为ST1、ST128、ST17和ST143;不同国家流行菌株的基因种和ST型不尽相同.致病性钩体可在不同宿主物种广泛地交叉感染,不同国家间相互传播.结论 获得我国致病性钩体基因种和MLST基因多态性资料,并系统地了解国内和全球致病性钩体种群结构和遗传进化关系,为后续致病性钩体监测和溯源提供科学指导.
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