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目的：了解西安市2012年手足口病肠道病毒71型分离株VP1区基因特征，探讨基因型与病情轻重间的关系。方法采集肠道病毒71型（EV71）患者咽拭子或粪便标本，按等概率法随机选择6例普通型和6例重型EV71分离株，用逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR）对EV71分离株进行VP1区基因扩增及核酸测序，并将测序结果与EV7各基因型代表株进行同源性和遗传进化分析。结果12株EV71分离株的基因型为C4基因亚型，其与C4亚型代表株VP1区核苷酸和氨基酸同源性最高，分别91.8%~93.0%和98.3%~99.3%，