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事业单位起源于计划经济时代,具有浓厚的时代特色,是我国的特殊管理形式。随着我国经济体制改革的不断深入,事业单位的改革也在不断向前推进。财务问题由于其延续性、复杂性、历史性等原因在改革中贯穿始终。财务管理、会计政策选择与变更、考核指标核算、关联方交易、各类项目管理等重大问题的解决直接制约着事业单位的改革进程。本文从管理体系建设及风险控制角度,对事业单位改革中的财务问题进行分析、归纳和总结,提出意见和建议,希望能够为解决其他事业单位改革中的财务问题提供一定借鉴。