番茄热激转录因子(Hsf)基因家族鉴定及表达分析

来源 :农业生物技术学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lgl5201314
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热激转录因子(heat shock transcription factor,Hsf)已经被证实是广泛地存在于植物细胞内的一类重要的转录调节基因,对植物抵抗高温逆境伤害和其他生命活动具有重要作用。本研究利用番茄(Lycopersicon esculentum)全基因组测序结果,鉴定番茄Hsf家族成员;通过生物信息学方法,分析其系统发育关系和染色体定位;利用已有的番茄芯片数据和q RT-PCR进行组织表达谱和基因表达响应分析。结果表明,番茄基因组含有25个Hsf基因家族成员,序列比对揭示其均具有转录因子特有的DNA结合域(DNA binding domain,DBD);根据拟南芥(Arabidopsis thaliana)、水稻(Oryza sativa)和黄瓜(Cucumis sativus L.)Hsf的基因结构和系统发育树将这些转录因子分为3个分支(A、B和C),细分为15个亚分支(A1~A9、B1~B4以及C1~C2)。染色体定位结果表明,25个Hsf基因除Chr.1和Chr.5外,其余不均匀分布在剩余10条染色体上。各个发育阶段表达谱分析表明,Hsf基因具有不同的表达模式,近一半的基因处于高表达水平。q RT-PCR分析表明,大多数Hsf家族成员参与番茄苗期应对高温热激反应。研究结果为揭示番茄Hsf基因的功能提供基础资料。
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