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国际经验表明，创新型国家的基础是高效运行的国家创新系统，创新驱动经济的持续发展有赖于国家创新系统的不断进步。“十一五”时期是实施自主创新战略、落实中长期科技发展纲要的关键期，国家创新系统建设是当前科技工作的重心，如果不能构建具有中国特色的国家创新系统，自主创新战略实施将受阻。政府在国家创新系统建设中的主导作用要体现在多个层次，既包括构建国家创新系统的机构框架，也包括建立促进创新系统高效运行的政策机制以及保障系统不断进步的监督与管理等等。