重组PCR构建bcr-abl mRNA竞争RT-PCR内标物

来源 :中华医学遗传学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ch3192530
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目的竞争PCR可用于mRNA的定量测定,为了得到白血病中bcr-ablmRNA定量PCR的竞争内标物。方法利用重组PCR技术,实施对b3a2型bcr-ablcDNA中一276bp片段的缺失法定点突变。结果经DNA序列分析证实,重组后的cDNA片段与重组前相比,5′和3′端大部分序列相同,仅中间55bp的部分序列缺失,同时引入19bp外源DNA片段,即净缺失36bp,得到240bp的重组PCR产物。较b2a2型bcr-ablcDNA相应的201bp扩增片段长39bp,使之适于作为b3a2和b2a2型两类bcr-ablmRNA定量PCR的通用内标物。结论表明重组PCR是一种获得靶基因的竞争性内标物的简便而可靠的方法 The purpose of competitive PCR can be used for quantitative determination of mRNA, in order to obtain competitive leukemia bcr-ablmRNA quantitative PCR internal standard. Methods Recombinant PCR technique was used to perform site-directed mutagenesis on a 276 bp fragment in b3a2-type bcr-ablcDNA. Results The DNA sequence analysis showed that most of the 5 ’and 3’ ends of the recombined cDNA fragments had the same sequence except that the 55 bp partial sequence was deleted. At the same time, a 19 bp foreign DNA fragment was introduced, ie, the net deletion was 36 bp. A 240 bp recombinant PCR product was obtained. The 201bp amplified fragment corresponding to b2a2-type bcr-ablcDNA was 39bp in length, making it suitable as a universal internal standard for quantitative PCR of bcr-abl mRNAs of b3a2 and b2a2 types. The conclusion suggests that recombinant PCR is a convenient and reliable method for obtaining competitive internal standards for target genes
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