【摘 要】
：
12-氧-植物二烯酸还原酶(12-oxo-phytodienoic acid reductase,OPR)是十八烷碳烯酸代谢途径中的一个关键酶,控制茉莉酸合成的最后步骤.本研究从葡萄(Vitis vinifera L)基因组中鉴定了9个OPR家族成员基因,分别命名为VvOPR1～VvOPR9.利用生物信息学和分子生物学方法,对葡萄OPR家族成员的理化性质、进化特征、基因表达和结构以及其启动子元件、染色体定位等进行了分析.结果 表明,9个VvOPR在系统发育树遗传进化关系上可分为两个亚组,组内进化相对保守;
【机 构】
：
重庆市农业科学院果树研究所,重庆,401329
论文部分内容阅读
12-氧-植物二烯酸还原酶(12-oxo-phytodienoic acid reductase,OPR)是十八烷碳烯酸代谢途径中的一个关键酶,控制茉莉酸合成的最后步骤.本研究从葡萄(Vitis vinifera L)基因组中鉴定了9个OPR家族成员基因,分别命名为VvOPR1～VvOPR9.利用生物信息学和分子生物学方法,对葡萄OPR家族成员的理化性质、进化特征、基因表达和结构以及其启动子元件、染色体定位等进行了分析.结果 表明,9个VvOPR在系统发育树遗传进化关系上可分为两个亚组,组内进化相对保守;染色体定位发现该家族基因仅分布在11号和18号染色体上;基因结构分析显示VvOPRs结构高度保守,尤其是保守基序motif6、motif4、motif2和motif3为所有基因共有;启动子分析显示,OPR基因的启动子区富含与生长发育、激素信号及逆境应答有关的顺式作用元件;荧光定量结果表明,VvOPR1、VvOPR2、VvOPR3、VvOPR7等4个基因在铜胁迫下表达量较高,推测它们可能参与了铜胁迫的应答.以上结果为今后进一步揭示葡萄VvOPR基因功能提供了重要的研究基础和理论依据.
其他文献
在新一轮科技革命和产业革命的推动下,建筑行业发展也将面临较大的变革.随着建筑业信息化及装配式建筑相关行业政策的出台,我国装配式建筑的发展已达到中期发展阶段,装配式建筑在管理过程中由于质量检验标准不规范、各参与方的协同管理水平较低、“设计—生产—施工”一体化理念尚未形成、新型智慧信息化综合技术应用不足等问题,严重制约了我国装配式建筑迈入新的发展阶段.为解决这些问题,本研究将精益管理思想、智慧化管理运用到装配式建筑管理的全生命周期中,可以更好地提升装配式建筑管理水平,并结合装配式建筑在管理过程中面临的各类问题
本研究以砂藓(Racomitrium canescens)为材料,克隆得到砂藓乙醇脱氢酶基因RcADH.在拟南芥(Arabidopsis thaliana)中构建了RcADH过表达株系.通过对其生物信息学分析显示:RcADH的cDNA开放阅读框长1140 bp,编码含有379个氨基酸残基的多肽序列.RcADH蛋白理论等电点为6.79;脂肪指数为89.0,不稳定系数为24.35,属于不稳定的蛋白质.分析蛋白的跨膜结构域,结果显示RcADH基因编码的蛋白不含跨膜区.预测RcADH蛋白质中没有信号肽,属于非分泌
顺-12-氧-植物二烯酸(cis(+)-12-oxophytodienoic acid,cis-OPDA)是不饱和脂肪酸代谢的中间产物,作为一种植物生长调节剂,对干旱胁迫造成的伤害具有一定的缓解效应.研究cis-OPDA对干旱胁迫下油用牡丹(Paeonia ostii)\'凤丹\'生长的影响,可为提升油用牡丹的抗旱栽培技术提供理论依据.本研究以长势一致、无病虫害的一年生油用牡丹\'凤丹\'实生苗为材料,采用整株喷施法,以不同浓度(0,50,100,200 mg/L)的cis-OPDA溶液处
荷叶离褶伞(Lyophyllum decastes)胞外酶具有较高的漆酶活性,漆酶在其子实体发育中发挥着重要的作用.荷叶离褶伞基因组已完成测序,但未注释.目前,鲜有其漆酶基因的报道.本研究采用同源预测的方法对其漆酶基因进行预测并对其编码蛋白的生物特性进行探究.以灰盖鬼伞(Coprinopsis cinerea)的漆酶氨基酸序列对荷叶离褶伞的全基因组序列进行tblastn比对,再通过Augustus进行基因预测分析得到其cDNA和蛋白序列,用Blastp验证筛选获得19个可能的荷叶离褶伞的漆酶基因.采用Pr
为探究不同程度的干旱胁迫对苦荞(Fagop yrum tataric um)在调节高脂血症2型糖尿病小鼠血糖、血脂、免疫力以及脏器指数的影响,以期为苦荞的保健价值开发提供科学依据,通过建立高脂血症2型糖尿病小鼠模型,将实验小鼠分组并灌胃实验材料(3种不同程度干旱胁迫培育出的苦荞),检测各组小鼠的空腹血糖值、血脂指标(T-CHO、TG、HDL-C、LDL-C)、免疫调节指标(TNF-α,CD4+,CD8+,CD4+/CD8+)和脏器指数(肝脏指数,胰腺指数,胸腺指数,脾脏指数).结果 发现,轻度干旱胁迫下苦
溶血磷脂酸酰基转移酶基因(lysophosphatideacid acyltransferases gene,LPAAT)是油脂合成的关键基因之一,其催化溶血磷脂酸合成磷脂酸,是高等植物Kennedy途径中的关键酶.本研究从油葵(Helianthus annuus)中克隆得到3个HaLPAAT2基因,分别命名为HaLPAAT2.1,HaLPAAT2.2和HaLPAAT2.3.对这3个HaLPAAT2进行了生物信息分析并将其转入SM2-1大肠杆菌突变体中验证LPAAT活性.结果 表明:HaL-PAAT2.1
miRNA在植物的生长发育过程中具有重要作用,选择合适内参基因是得到准确定量结果的基础.本研究以青花菜(Brassica oleracea var.italica)花蕾为试验材料,使用RT-qPCR技术检测了8个候选内参基因(miR167,miR160,miR398,miR824,U6,U4,5S和5.8S)的表达水平.同时利用geNorm、NormFinder和BestKeeper软件分析其稳定性,最终得出U6和5S分别是花蕾4个不同部位以及花蕾不同发育时期的适宜内参基因.本研究结果可为进一步准确定量青
为了获得金钗石斛(Dendrobium nobile)过氧化物酶基因(命名为DnPOD)编码序列,分析该基因的分子特征,掌握该基因原核表达数据,本研究采用同源克隆的方法,以金钗石斛cDNA为模板,设计基因特异性引物克隆DnPOD基因,分析了DnPOD基因结构,将重组质粒pET28α-DnPOD在BL21 (DE3)菌株中诱导表达,构建了DnPOD蛋白3D结构以及进化树.结果 表明,DnPOD基因编码区长999 bp,编码332个氨基酸,该基因具有4个外显子和3个内含子.经IPTG诱导表达的蛋白质分子量为3
WRKY转录因子基因家族是植物特有的基因家族之一,在植物整个生长发育、生物和非生物胁迫等生物过程中发挥重要调控作用.为进一步揭示杜仲WRKY转录因子家族成员信息,本研究利用生物信息学方法对杜仲(Eucommia ulmoides)WRKY转录因子家族成员进行鉴定,并对其进化关系、基因结构、理化性质、染色体定位和基因表达模式进行分析.结果 显示,杜仲全基因组中共鉴定出51条EuWRKY基因,且EuWRKY基因家族可分为Group Ⅰ、Group Ⅱ和Group Ⅲ三组,Group Ⅱ组可分为Ⅱ-a、Ⅱ-b、
TkCPT1基因是橡胶草(Taraxacum kok-saghyz)合成顺式橡胶过程中的一个重要基因.本实验运用生物信息学手段对橡胶草中顺式异戊烯基转移酶(cis isoprene transferase,CPT)进行一系列特征分析,并利用农杆菌介导的遗传转化法,通过超量表达TkCPT1基因遗传转化烟草,获得转基因烟草植株后对其进行比较分析.结果 显示,橡胶草的CPT基因与烟草(Nicotiana tabacum)的一部分CPT基因在进化关系上更近,且鉴定的这4个物种(橡胶草,橡胶树(Hevea bras